Le SOFAIR book

par Mario Adam¹, Stéphane Bujacic¹, Manuel Chevé², Paloma Cucchi¹, Mikaël Faucheux¹, Ophélie Fovet¹, Christophe Geneste¹, Tom Loree¹, Olivier Maury⁴, Thierry Morvan¹, Pascal Pichelin¹, Paul Robin¹, François Rouault¹, Laurent Ruiz³, Hervé Squividant¹, Zahra Thomas¹

1. UMR SAS - INRAE, Institut Agro - Rennes, Quimper

2. UMR DECOD - IFREMER, INRAE, Institut Agro - Brest, Lorient, Nantes, Rennes

3. UMR G-EAU - INRAE, CIRAD, IRD, AgroParisTech, Institut Agro, BRGM, Montpellier

4. US AGROCLIM - INRAE, Avignon

Mise à disposition selon les termes de la Licence Creative Commons 4.0

Objectif

L’ambition du projet SOFAIR est de partager un ensemble d’outils et de méthodes pour faciliter l’ouverture des données d’observation produites dans le cadre de la recherche en environnement.

Il repose sur les principes du FAIR data qui incitent les scientifiques à publier les données produites par leurs recherches, de telle sorte qu’elles soient aisément trouvables (Findable), librement accessibles (Accessible), interopérables (Interoperable) et réutilisable (Reusable).

Enjeux

L’ouverture des données produites par la recherche est une des composantes de la science ouverte. Les services web sont des outils appropriés pour diffuser ces données en les rendant trouvables (F de Fair) et librement accessibles (A de fAir). L’interopérabilité (I de faIr) repose sur des standards ouverts basés sur des spécifications reconnues à l’échelle internationale initiées dans le domaine géospatial par l’Open Geospataial Consortium (OGC). Ces normes incluent la nécessité d’associer à la publication des données, la publication de métadonnées garantes de leur reutilisabilité (R de faiR).

Dans le cadre du projet SOFAIR, on investigue l’usage du standard OGC nommé SensorThings pour la FAIRisation des données d’observation de l’environnement. Un premier exemple d’utilisation du SensorThings appliqué à un observatoire hydrologique est décrit dans le chapitre Le SensorThings, ça sert à quoi ?. Un historique de l’ouverture des données géographiques et temporelles explique le choix du SensorThings, dans le chapitre Pourquoi le SensorThings ?. Un ensemble d’outils et de méthodes en libre accès, ont été développés et mis au point par ce groupe de travail pour FAIRISER un observatoire. Un chapître consacré à la réutilisation d’un service SensorThings propose un tour d’horizon des outils web ou desktop existants ainsi que des exemples de requêtes destinés à des utilisateurs experts. Enfin, nous détaillons les procédures pour installer les outils dévéloppés ou présentés dans ce document.

Groupe de travail

SOFAIR est le fruit d’un groupe de travail né dans les unités de recherche UMR SAS, DECOD et G-EAU réunissant différentes compétences :

• des métrologues, spécialistes des appareils de mesure (Sensors),

• des chercheurs, concepteurs des protocoles d’observation et/ou utilisateurs des données d’observation pour leurs travaux de recherche,

• des informaticiens données, experts en gestion et administration de la donnée,

• des développeurs informatiques, concepteurs de services web ou d’API (Application Programming Interface),

• des ingénieurs des Systèmes d’Information, responsables de plateformes Open Data.