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Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune

Les communautés microbiennes jouent un rôle majeur dans le fonctionnement des écosystèmes : elles sont à la base de la chaîne alimentaire (production primaire) et participent à la dégradation de la matière organique. Ces communautés sont, de plus, connues pour répondre rapidement à des changements environnementaux. Elles peuvent être utilisées comme indicateurs écologiques, à l'instar des macro-invertébrés.

Les diatomées benthiques sont les organismes photosynthétiques majoritaires au sein de cette communauté biologique. L’abondance relative des différentes espèces permet de calculer un indice de qualité du milieu (IBD). Des fortes différences de communautés entre les zones amont et aval ont été constatés quand les barrages étant en place. Elles seront amenées à évoluer après l’effacement de ces barrages.

Dans le cadre de l'observatoire Sélune ont été disposées des stations pilotes le long du cours principal de la Sélune, réparties de l’amont à l’aval des barrages hydroélectriques. Trois stations se situent dans les anciennes retenues des barrages, les deux autres, dites de référence, sont hors zone d'influence des anciens barrages (l'une étant en aval et l'autre en amont). Dans ces stations, les biocénoses aquatiques (incluant macroinvertébrés benthiques, biofilms, macrophytes...) sont suivies. Depuis septembre 2014, les stations sont idéalement échantillonnées tous les mois d’Avril à Octobre (7 relevés annuels) à l'aide de substrats artificiels (lames de verre disposées dans l'eau). En plus du relevé des diatomées (liste floristique, calcul de l'IBD), la concentration en chlorophylle-a est mesurée.

Lors de chaque campagne, un protocole d'échantillonnage expérimental INRAe est mis en oeuvre. Ce protocole implique des dispositifs d'immersion (1 mois) de lames de verre, une mesure in situ de concentration en chlorophylle-a via BentoTorch puis une récolte du biofilm sur ces lames de verre. Le biofilm est conditionné dans (1) dans de l'éthanol à 99.9% pour la détermination des IBDs et des listes floristiques (prestation externalisée, s'appuyant sur la norme NF T90-354) et (2) dans de l'eau minérale pour mesure de concentration de la chlorophylle-a via spectromètre.

La détermination des taxons s'appuie sur la version v17 de la référence TAXREF.

Le jeu de données est actuellement sous embargo.

Simple

Date ( Création )
2025-03-04T16:00:00
Edition
2025
Identificateur
fr-20250303103810-umrsas-selune-v_bioc_biofilm_ind_biofilm
But
Cette couche donne les listes floristiques ayant permis d'obtenir les indices biotiques IBD et IBD normalisés (EQR).
Etat
Planifié
Point de contact
INRAE DECOD - Jean-Marc Roussel ( )
65 rue de Saint-Brieuc - CS 84215 Rennes 35042 France

+33 2 23 48 57 86
Point de contact
INRAE DECOD - Gorzérino Caroline ( )

funder
AESN - ( )
1, rue de la Pompe - BP 70087 HEROUVILLE SAINT-CLAIR Cedex 14203 France

02 31 46 20 20
Point de contact
Université de Rennes - Pannard Alexandrine

Gestionnaire
INRAE U3E - Nadine Herrard

Fréquence de mise à jour
Lorsque nécessaire
Remarque sur la mise à jour
Dernière mise à jour : 05/03/2024 avec les données de l'automne 2024
Mots clés ( Thème )
  • Données ouvertes
Mots clés ( Thème )
  • Limite
Thèmes INSPIRE Thèmes INSPIRE INSPIRE themes ( Thème )
  • Installations de suivi environnemental
  • Environnement
GEMET GEMET ( Thème )
  • biologie
  • environnement
  • faune
Limitation d'utilisation
Usage libre sous réserve des mentions obligatoires sur tout document de diffusion : "Source : INRAE - U3E"
Limitation d'utilisation
Licence ouverte : https://www.etalab.gouv.fr/licence-ouverte-open-licence
Contraintes d'accès
Restreint
Contraintes d'utilisation
Restreint
Autres contraintes
Jeu de données actuellement sous embargo
Type de représentation spatiale
Vecteur
Dénominateur de l'échelle
25000
Langue
fre
Catégorie ISO
  • Environment
  • Location
N
S
E
W


Date de début
2014-01-01
Date de fin
2027-12-31
Nom du système de référence
RGF93 / Lambert-93 (EPSG:2154)
Type de géométries des objets
Point

Distributeur

Distributeur
UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest - Pole GéoSAS
65 rue de Saint-Brieuc Rennes cedex 35042 France

Nom
ESRI Shapefile
Version
1.0
Ressource en ligne
Observatoire Sélune ( WWW:LINK-1.0-http--link )
Ressource en ligne
Qualité de l'eau - Échantillonnage, traitement et analyse de diatomées benthiques en cours d'eau et canaux NF T90-354 ( WWW:LINK-1.0-http--link )

Le présent document spécifie une méthode pour l'échantillonnage, la préparation, l'identification et l'établissement de proportions relatives de diatomées benthiques en vue de constituer une liste floristique notamment à des fins d'évaluation de la qualité des eaux. Elle est applicable à la partie continentale d'un cours d'eau naturel ou artificialisé et aux canaux de France métropolitaine. Elle peut également être appliquée dans les départements et collectivités d'outre-mer, dans le cas où cette approche est pertinente et adaptée (territoires ci-après dénommés DROM-COM).

Ressource en ligne
v_bioc_biofilm_ind_biofilm ( OGC:WMS )

Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune

Ressource en ligne
selune:v_bioc_biofilm_ind_biofilm ( OGC:WFS )

Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune

Ressource en ligne
Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format JSON ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
Ressource en ligne
Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format CSV ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
Ressource en ligne
Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format shapefile ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
Niveau
Jeu de données

Résultat de conformité

Date ( Publication )
2013-12-10
Explication
Non Evalué
Degré de conformité
Non
Généralités sur la provenance

Listes floristiques et abondances obtenues suivant la norme NF T90-354 (Novembre 2021).

La liste des champs présentés dans ce jeu de données est précisé dans le catalogue associé.

Référence du catalogue d'objet
  • Observatoire Sélune - Dictionnaire des attributs Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées

gmd:MD_Metadata

Identifiant de la fiche
0b477872-ce4c-4c21-8788-48f03912f05a XML
Langue
fre
Jeu de caractères
Utf8
Identifiant de la fiche de métadonnées parent
Sélune scientific program 32b2d23e-0f67-46fb-ad72-110514f1c8ee
Type de ressource
Jeu de données
Date des métadonnées
2025-04-02T17:18:16
Nom du standard de métadonnées
ISO 19115
Version du standard de métadonnées
1.0
Point de contact
UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest - GéoSAS ( )
65 rue de Saint-Brieuc - CS 84215 Rennes France 35042 France

00 33 (0)2 98 95 99 68 http://geowww.agrocampus-ouest.fr

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