0b477872-ce4c-4c21-8788-48f03912f05a fre e91b4cb1-252d-4ae9-bdf4-24366af7a87c GéoSAS GéoSAS UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest 00 33 (0)2 98 95 99 68 65 rue de Saint-Brieuc - CS 84215 65 rue de Saint-Brieuc - CS 84215 Rennes France 35042 France France geosas_adm@framalistes.org geosas_adm@framalistes.org http://geowww.agrocampus-ouest.fr WWW:LINK-1.0-http--link application profile contact instructions contact instructions 2025-11-06T16:23:31 ISO 19115 1.0 RGF93 / Lambert-93 (EPSG:2154) RGF93 / Lambert-93 (EPSG:2154) Liste floristique des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune Liste floristique des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune Floristic list of biological indices based on diatoms - Sélune Observatory 2025-03-04T16:00:00 2025 fr-20250303103810-umrsas-selune-v_bioc_biofilm_ind_biofilm Les communautés microbiennes jouent un rôle majeur dans le fonctionnement des écosystèmes : elles sont à la base de la chaîne alimentaire (production primaire) et participent à la dégradation de la matière organique. Ces communautés sont, de plus, connues pour répondre rapidement à des changements environnementaux. Elles peuvent être utilisées comme indicateurs écologiques, à l'instar des macro-invertébrés. Les diatomées benthiques sont les organismes photosynthétiques majoritaires au sein de cette communauté biologique. L’abondance relative des différentes espèces permet de calculer un indice de qualité du milieu (IBD). Des fortes différences de communautés entre les zones amont et aval ont été constatés quand les barrages étant en place. Elles seront amenées à évoluer après l’effacement de ces barrages. Dans le cadre de l'observatoire Sélune ont été disposées des stations pilotes le long du cours principal de la Sélune, réparties de l’amont à l’aval des barrages hydroélectriques. Trois stations se situent dans les anciennes retenues des barrages, les deux autres, dites de référence, sont hors zone d'influence des anciens barrages (l'une étant en aval et l'autre en amont). Dans ces stations, les biocénoses aquatiques (incluant macroinvertébrés benthiques, biofilms, macrophytes...) sont suivies. Depuis septembre 2014, les stations sont idéalement échantillonnées tous les mois d’Avril à Octobre (7 relevés annuels) à l'aide de substrats artificiels (lames de verre disposées dans l'eau). En plus du relevé des diatomées (liste floristique, calcul de l'IBD), la concentration en chlorophylle-a est mesurée. Lors de chaque campagne, un protocole d'échantillonnage expérimental INRAe est mis en oeuvre. Ce protocole implique des dispositifs d'immersion (1 mois) de lames de verre, une mesure in situ de concentration en chlorophylle-a via BentoTorch puis une récolte du biofilm sur ces lames de verre. Le biofilm est conditionné dans (1) dans de l'éthanol à 99.9% pour la détermination des IBDs et des listes floristiques (prestation externalisée, s'appuyant sur la norme NF T90-354) et (2) dans de l'eau minérale pour mesure de concentration de la chlorophylle-a via spectromètre. La détermination des taxons s'appuie sur la version v17 de la référence TAXREF. Le jeu de données est actuellement sous embargo. Les communautés microbiennes jouent un rôle majeur dans le fonctionnement des écosystèmes : elles sont à la base de la chaîne alimentaire (production primaire) et participent à la dégradation de la matière organique. Ces communautés sont, de plus, connues pour répondre rapidement à des changements environnementaux. Elles peuvent être utilisées comme indicateurs écologiques, à l'instar des macro-invertébrés. Les diatomées benthiques sont les organismes photosynthétiques majoritaires au sein de cette communauté biologique. L’abondance relative des différentes espèces permet de calculer un indice de qualité du milieu (IBD). Des fortes différences de communautés entre les zones amont et aval ont été constatés quand les barrages étant en place. Elles seront amenées à évoluer après l’effacement de ces barrages. Dans le cadre de l'observatoire Sélune ont été disposées des stations pilotes le long du cours principal de la Sélune, réparties de l’amont à l’aval des barrages hydroélectriques. Trois stations se situent dans les anciennes retenues des barrages, les deux autres, dites de référence, sont hors zone d'influence des anciens barrages (l'une étant en aval et l'autre en amont). Dans ces stations, les biocénoses aquatiques (incluant macroinvertébrés benthiques, biofilms, macrophytes...) sont suivies. Depuis septembre 2014, les stations sont idéalement échantillonnées tous les mois d’Avril à Octobre (7 relevés annuels) à l'aide de substrats artificiels (lames de verre disposées dans l'eau). En plus du relevé des diatomées (liste floristique, calcul de l'IBD), la concentration en chlorophylle-a est mesurée. Lors de chaque campagne, un protocole d'échantillonnage expérimental INRAe est mis en oeuvre. Ce protocole implique des dispositifs d'immersion (1 mois) de lames de verre, une mesure in situ de concentration en chlorophylle-a via BentoTorch puis une récolte du biofilm sur ces lames de verre. Le biofilm est conditionné dans (1) dans de l'éthanol à 99.9% pour la détermination des IBDs et des listes floristiques (prestation externalisée, s'appuyant sur la norme NF T90-354) et (2) dans de l'eau minérale pour mesure de concentration de la chlorophylle-a via spectromètre. La détermination des taxons s'appuie sur la version v17 de la référence TAXREF. Le jeu de données est actuellement sous embargo. Microbial communities play a major role in the functioning of ecosystems: they are at the base of the food chain (primary production) and participate in the degradation of organic matter. These communities are also known to respond rapidly to environmental changes. Like macro-invertebrates, they can be used as ecological indicators. Benthic diatoms are the main photosynthetic organisms in this biological community. The relative abundance of the different species is used to calculate an environmental quality index (EQI). Major differences in communities between the upstream and downstream zones were observed when the dams were in place. These differences will change once the dams are removed. As part of the Sélune observatory, pilot stations have been set up along the main course of the Sélune, distributed from upstream to downstream of the hydroelectric dams. Three stations are located in the former reservoirs of the dams, while the other two, known as the reference stations, are outside the area of influence of the former dams (one downstream and the other upstream). At these stations, aquatic biocenoses (including benthic macroinvertebrates, biofilms, macrophytes, etc.) are monitored. Since September 2014, the stations are ideally sampled every month from April to October (7 annual surveys) using artificial substrates (glass slides placed in the water). In addition to the diatom survey (floristic list, IBD calculation), the chlorophyll-a concentration is measured. During each campaign, an INRAe experimental sampling protocol is implemented. This protocol involves the immersion (1 month) of glass slides, in situ measurement of chlorophyll-a concentration via BentoTorch and then collection of the biofilm on these glass slides. The biofilm is conditioned in (1) 99.9% ethanol for determination of IBDs and floristic lists (outsourced service, based on standard NF T90-354) and (2) mineral water for measurement of chlorophyll-a concentration using a spectrometer. Taxon identification is based on version v17 of the TAXREF reference. The dataset is currently under embargo. Cette couche donne les listes floristiques ayant permis d'obtenir les indices biotiques IBD et IBD normalisés (EQR). Cette couche donne les listes floristiques ayant permis d'obtenir les indices biotiques IBD et IBD normalisés (EQR). This layer gives the lists of flora used to obtain the standardised IBD and IBD biotic indices (EQR). Jean-Marc Roussel Jean-Marc Roussel INRAE DECOD INRAE DECOD +33 2 23 48 57 86 65 rue de Saint-Brieuc - CS 84215 65 rue de Saint-Brieuc - CS 84215 Rennes 35042 France France jean-marc.roussel@inrae.fr jean-marc.roussel@inrae.fr Gorzérino Caroline Gorzérino Caroline INRAE DECOD INRAE DECOD caroline.gorzerino@inrae.fr caroline.gorzerino@inrae.fr AESN AESN 02 31 46 20 20 1, rue de la Pompe - BP 70087 1, rue de la Pompe - BP 70087 HEROUVILLE SAINT-CLAIR Cedex 14203 France France aesn@aesn.fr aesn@aesn.fr Pannard Alexandrine Pannard Alexandrine Université de Rennes Université de Rennes alexandrine.pannard@univ-rennes.fr alexandrine.pannard@univ-rennes.fr Nadine Herrard Nadine Herrard INRAE U3E INRAE U3E nadine.herrard@inrae.fr nadine.herrard@inrae.fr Dernière mise à jour : 05/03/2024 avec les données de l'automne 2024 Dernière mise à jour : 05/03/2024 avec les données de l'automne 2024 Last update: 05/03/2024 with autumn 2024 data https://geosas.fr/geonetwork/siselune/api/records/0b477872-ce4c-4c21-8788-48f03912f05a/attachments/image_biofilm.png Données ouvertes Données ouvertes Open data Limite Limite Limit Installations de suivi environnemental Installations de suivi environnemental Environmental monitoring facilities Environnement Environnement Environnement Thèmes INSPIRE Thèmes INSPIRE INSPIRE themes 2008-06-01 geonetwork.thesaurus.external.theme.inspire-theme biologie biologie biology environnement environnement environment faune faune fauna GEMET GEMET 2021-06-28 geonetwork.thesaurus.external.theme.gemet Usage libre sous réserve des mentions obligatoires sur tout document de diffusion : "Source : INRAE - U3E" Usage libre sous réserve des mentions obligatoires sur tout document de diffusion : "Source : INRAE - U3E" Unrestricted use subject to the following compulsory wording on all distribution documents: "Source: INRAE - U3E". Licence ouverte : https://www.etalab.gouv.fr/licence-ouverte-open-licence Licence ouverte : https://www.etalab.gouv.fr/licence-ouverte-open-licence Open licence : https://www.etalab.gouv.fr/licence-ouverte-open-licence Jeu de données actuellement sous embargo Jeu de données actuellement sous embargo Data set currently under embargo 25000 fre environment location -1.46391 -0.753436967 48.34434 48.70325 2014-01-01 2027-12-31 Pole GéoSAS Pole GéoSAS UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest UMR 1069 SAS INRA - Agrocampus Ouest 65 rue de Saint-Brieuc 65 rue de Saint-Brieuc Rennes cedex 35042 France France geosas_adm@framalistes.org geosas_adm@framalistes.org ESRI Shapefile ESRI Shapefile 1.0 https://programme-selune.com/fr/observatoire/ WWW:LINK-1.0-http--link Observatoire Sélune Observatoire Sélune Selune Observatory https://norminfo.afnor.org/norme/nf-t90-354/qualite-de-leau-echantillonnage-traitement-et-analyse-de-diatomees-benthiques-en-cours-deau-et-canaux/95749 WWW:LINK-1.0-http--link Qualité de l'eau - Échantillonnage, traitement et analyse de diatomées benthiques en cours d'eau et canaux NF T90-354 Qualité de l'eau - Échantillonnage, traitement et analyse de diatomées benthiques en cours d'eau et canaux NF T90-354 Water quality - Sampling, treatment and analysis of benthic diatoms in rivers and canals NF T90-354 Le présent document spécifie une méthode pour l'échantillonnage, la préparation, l'identification et l'établissement de proportions relatives de diatomées benthiques en vue de constituer une liste floristique notamment à des fins d'évaluation de la qualité des eaux. Elle est applicable à la partie continentale d'un cours d'eau naturel ou artificialisé et aux canaux de France métropolitaine. Elle peut également être appliquée dans les départements et collectivités d'outre-mer, dans le cas où cette approche est pertinente et adaptée (territoires ci-après dénommés DROM-COM). Le présent document spécifie une méthode pour l'échantillonnage, la préparation, l'identification et l'établissement de proportions relatives de diatomées benthiques en vue de constituer une liste floristique notamment à des fins d'évaluation de la qualité des eaux. Elle est applicable à la partie continentale d'un cours d'eau naturel ou artificialisé et aux canaux de France métropolitaine. Elle peut également être appliquée dans les départements et collectivités d'outre-mer, dans le cas où cette approche est pertinente et adaptée (territoires ci-après dénommés DROM-COM). This document specifies a method for sampling, preparing, identifying and establishing relative proportions of benthic diatoms with a view to compiling a floristic list, particularly for the purpose of assessing water quality. It applies to the continental part of a natural or artificial watercourse and to canals in mainland France. It may also be applied in overseas departments and collectivities, where this approach is relevant and appropriate (hereinafter referred to as DROM-COM territories). https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WMS OGC:WMS v_bioc_biofilm_ind_biofilm v_bioc_biofilm_ind_biofilm Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WFS OGC:WFS selune:v_bioc_biofilm_ind_biofilm selune:v_bioc_biofilm_ind_biofilm Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WFS&version=1.0.0&request=GetFeature&typeName=selune%3Av_bioc_biofilm_ind_biofilm&outputFormat=application%2Fjson WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format JSON Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format JSON Download ‘Floristic lists of biological indices based on diatoms - Sélune Observatory’ in JSON format https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WFS&version=1.0.0&request=GetFeature&typeName=selune%3Av_bioc_biofilm_ind_biofilm&outputFormat=csv WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format CSV Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format CSV Download ‘Floristic lists of biological indices based on diatoms - Sélune Observatory’ in CSV format https://geosas.fr/geoserver/selune/ows?service=WFS&version=1.0.0&request=GetFeature&typeName=selune%3Av_bioc_biofilm_ind_biofilm&outputFormat=SHAPE-ZIP WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format shapefile Télécharger "Listes floristiques des indices biologiques basés sur les diatomées - Observatoire Sélune" au format shapefile Download "Floristic lists of biological indices based on diatoms - Sélune Observatory" au format shapefile INSPIRE Data Specification for the spatial data theme Elevation INSPIRE Data Specification for the spatial data theme Elevation 2013-12-10 Non Evalué Non Evalué false Listes floristiques et abondances obtenues suivant la norme NF T90-354 (Novembre 2021). La liste des champs présentés dans ce jeu de données est précisé dans le catalogue associé. Listes floristiques et abondances obtenues suivant la norme NF T90-354 (Novembre 2021). La liste des champs présentés dans ce jeu de données est précisé dans le catalogue associé. Floristic lists and abundances obtained in accordance with standard NF T90-354 (November 2021). The list of fields presented in this dataset is specified in the associated catalogue.